原间隔序列邻近基序，前间隔序列邻近基序

CRISPR靶向特异性是由两部分决定的，一部分是RNA嵌合体和靶DNA之间的碱基配对，另一部分是Cas9蛋白和一个短DNA序列，这个短的DNA序列通常在靶DNA的3‘‘末端作用，被称为protospacer adjacent motif（PAM）。