表达序列标签在寄生虫功能基因组学研究中的应用
序列表达标签
expressed sequence tag
缩略语:EST
基因表达系列分析(SAGE)是通过快速和详细分析成千上万个EST(express sequenced tags)来寻找出表达丰富度不同的SAGE标签序列。再次访法中,通过限制性酶切可以产生非常短的cDNA(10-14bp)标签,并通过PCR扩增和连接,随后对连接题进行测序。SAGE大大简化和加快了3’端表达序列标签的收集和测序。同DD一样,SAGE是一个“开放”的系统,可以发现新的未知的序列。在进行标本的比较之前,SAGE在cDNA的产生和处理上需要较多个步骤。由于SAGE是一个依赖DNA测序的基因计量方法,它对基因表达的测定比 DD更加量化。由于需要进行大量的测序反应,所以费用因素使大多数研究机构对其广泛应用的主要限制。
相关例句
(2)1056个基因差异表达基因中,EST片段130个、功能未知蛋白或假设蛋白248个、已知功能的独立基因(Unigene)678个;
表达序列标签(Expressed Sequence Tag,EST)技术是近年兴起的一种高通量基因筛选和鉴别的有效方法。
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